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  • 【R语言】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案 - 简书
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    热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图。 参数像积木，拼凑出你最喜欢的热图即可，如下图： 基因和样本都可以单独聚类，排序，聚类再分组，行列注释，配色调整，调整聚类线以及单元格的宽度和高度均可实现。 载入数据，R包 # 构建测试数据 绘制热图 绘制默认热图 基本参数 #表示行聚类使用皮尔森相关系数聚类，默认为欧氏距离"euclidean" #行 列是否聚类，cluster_row ,cluster_col # treeheight_row和treeheight_col参数设定行和列聚类树的高度，默认为50 # 设定cell 的大小 设定 text
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    前面给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+R自带的配色方案来绘制热图 ☞ 【R语言】热图绘制-heatmap函数+默认配色方案 ☞R语言中的颜色 (一)-自带的调色板 也给大家介绍了如何使用R自带的heatmap函数+gplots的…
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